情绪障碍发生的原因，学者曾归纳为内在因素和外在内素（Coleman, 1996），或归纳为生理因素、家庭因素、学校因素、及社会文化因素（Kauffman, 1996）。分别说明如下：
Coleman的归纳 内在因素： 生理、病理因素： 如脑伤、遗传、脑部功能失调等。 心理因素： 如低自尊、精神异常、道德意识薄弱等。 智力因素： 如低智力、阅读、学习困难或其它能力低弱者等。 外在因素： 社经因素： 如贫穷、社会阶层、种族、性别。 家庭因素： 身体发展史、性虐待、父母教养不良、兄弟姊妹的争斗等。 意外事件或环境中的事故： 如亲人死亡、父母分离、亲人的疾病或残障等。 学校因素： 如升学主义、智育导向教学、管教不当、教育环境不适当等。 社会文化因素： 如次文化、电视、电影、广告、新闻媒体的不良报导或示范，抑或不当娱乐场所的影响等。
Kauffman的归纳
生理因素： 遗传：研究中发现有些精神疾病与遗传有较大关联。 生化因子：生化学的研究发现： (1)躁郁症与纳电解质有关联。 (2)情感性精神疾病与中枢神经系统及脑下垂体、荷尔蒙的变化有关。 (3)中枢神经系统的神经介质传导功能失调、变异，可能导玫情绪／行为的障碍。 家庭因素： 低社经地位、破碎家庭、单亲、管教态度不一致、严苛、放纵、家庭暴力、虐待儿童…等，均较易导致儿童的情绪与行为问题。 学校因素： 学生学业成绩低落、低成就。 低的IQ，无法跟上学习进度。 升学主义，过度强调智育导向。忽略其它方面的教育价值 教师的管教态度不当。 同侪不良行为的相互影响。 社会文化因素： 文化价值与标准的冲突。 大众传播媒体的不良影响。 帮派、次文化、小区同侪团体的影响。 社会阶级、种族歧视或冲突的因素。 理观或道德意识的淡薄。 其它原因：不明原因情绪障碍的相关因素 生理因素
由生理因素探讨情绪与行为障碍，主要讨论遗传因素、生化/神经因素、营养学及气质因素等方面。
遗传因素：由遗传基因论点观之，儿童本身的许多特质系遗传自父母家族。基因愈相近（如孪生者），受到遗传基因影响的比率就愈高。染色体基因异常（如不健全或脆弱性X染色体），即可能导致智障、情绪行为、活动过多或学习方面的异常。此外，性联染色体的遗传，可能是使男女生，特别是在青春期后，对于情绪压抑及社会行为上的表现有所差异，因而也可能产生不同型态的情绪或行为问题。但学者也认为「社会环境」和「儿童基因、特质」的交互影响，才是情绪与行为问题产生的更主要原因。
生化/神经因素：包含脑伤、脑神经功能失调或新陈代谢失调等问题。
1. 脑伤：生产前（如母亲于怀孕期间滥用药物、酗酒、吸毒、抽烟等）、生产中（如细菌感染、缺氧等）、生产后（如病毒感染等）或意外事件中所造成的脑伤，如为人所熟知的「脑缺氧」即是脑伤成因之一。脑伤常会妨碍行为的敏感性、抑制性或造成受伤者的被动、分心、行为暴躁或无生气等，容易衍生出情绪方面的障碍。
2. 脑神经功能失调：中枢神经的某一部份受伤、缺陷、或神经传导的失常都可能是引发情绪及行为障碍原因之一。
3. 新陈代谢失调：有些学者认为副肾素新陈代谢的失调会导致失控的情绪或行为问题。
营养因素：因食物而导致情绪及行为障碍的论点，尚未获得证实。但若严重及长期的营养不良或营养不均衡，可能会减低儿童对刺激的反应，甚而对社会产生恐惧、不安的感觉，因而对儿童的情绪行为产生不良影响。此外，长期营养不均，如糖分摄取过多，亦可能会对儿童的某些行为产生不利的影响。
气质因素：气质是与生俱来的特质，不同的个人气质加上周围环境因素的作用，就会由个体的情绪行为表现中反映出来。
环境因素
儿童的情绪与行为障碍问题，是由个体因素和环境因素交互作用形成，因此环境也是重要影响因素。影响儿童的环境因素中，以家庭因素及学校因素最为重要，分别说明如下:
家庭因素：
家庭中父母的行为模式，对儿童具有极大的影响力 。父母亲如表现不良行为将直接影响儿童的行为表现。双亲的所作所为常是导致儿童行为问题的主因， 而儿童的行为问题亦会影响双亲的管教态度，彼此相互影响，恶性循环。家庭中影响儿童的情绪行为因素，主要有下述：
1. 管教方式：面对儿童的行为表现，若父母管教态度不一致、严苛、暴戾或放任，易使儿童养成说谎、退怯、焦躁、反抗、残酷、攻击、不负责或违规等负面行为。
2. 家庭气氛：家庭中父母亲的相处气氛，是处于和谐或暴戾， 将影响儿童的态度及情绪行为的发展型态。
3. 亲子互动：父母亲与孩子互动的质与量，影响儿童社会技能的学习。父母若忽略与婴幼儿及儿童保持适当的互动关系，未能常给予微笑、关注、 或对话， 对其长大后的情绪行为发展，易偏负面方向。
学校因素
1. 学习成就水平：当成功预期高，却遭遇严重失败时，最易形成情绪困扰。
2. 管教方式：学校教育措施和教师的管教态度、期望与方式等，如缺乏关爱、不当体罚、过于严苛或放任，易导致师生冲突及同侪冲突，亦将直接或间接地促使学生异常行为的产生。
3.升学主义：忽略其它教育价值，只过度强调智育成绩及学业竞争，易导致师生的压力，延伸许多负面价值与行为。
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